Die GeoUnion Alfred-Wegener-Stiftung hat satzungsgemäß die nachfolgend aufgeführten Organe. Einzelheiten sind der Satzung direkt zu entnehmen.

Trägereinrichtungen
Die GeoUnion Alfred-Wegener-Stiftung wird als deren Dachverband von den geowissenschaftlichen Einrichtungen und Vereinigungen in Deutschland getragen. Die Trägereinrichtungen

Präsidium
Das Präsidium hat bis zu 40 stimmberechtigte Mitglieder (jede Trägereinrichtungt benennt ein Mitglied), wobei bis zu fünf Mitglieder kooptiert werden können. Das Präsidium

Kuratorium
Dem vom Präsidium gewählten Kuratorium gehören bis zu 35 Mitglieder an.

Geschäftsführendes Präsidium
Das Geschäftsführende Präsidium besteht aus dem Präsidenten, bis zu sechs Vizepräsidenten und dem Schatzmeister. Es wird vom Präsidium gewählt.

Beauftragte
- für die AW-Konferenzen
- für Fachfragen
- für Veröffentlichungen

Geschäftsführer
Der Geschäftsführer wird vom Geschäftsführenden Präsidium bestellt und leitet die  Geschäftsstelle

Verein zur Förderung der GeoUnion Alfred-Wegener-Stiftung e.V.